El Consejo Directivo está conformado por cinco miembros quienes evalúan y aprueban los proyectos que corresponden a la capacitación e infraestructura. Asimismo, proponen proyectos estratégicos que mejoren la calidad de los servicios educativos.
Está compuesto por:
Gobernador Regional del Callao o su representante (quien lo preside).
Representante de la Mesa de Concertación para la Lucha contra la Pobreza
Representante del Consejo Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación Tecnológica (CONCYTEC)
Representante de la Universidad Nacional del Callao (UNAC)
Representante de la Dirección Regional del Callao (DREC)